gap extension penalty的意思|示意

延伸罚分 Penalty) ：10 ；空位延伸罚分(Gap Extension Penalty) ：0.10 ；蛋白权重矩阵(Protein weight matrix) ：Gonnet 系列；DNA 权重矩阵：IUB ；Toggle 慢/ 快逐对比对＝ SLOW 或FULL

空位拓展罚分 空位拓展罚分 (gap extension penalty) n/a -E number PSI-BLAST反复 (PSI-BLAST iterations) n/a -j number

缺口延伸罚分 罚分(gap penalty) 是-12，并且缺口延伸罚分(gap extension penalty) 是-2。

空位扩展罚分 吸＝d+（g-1）e （2-1） 其中d表示空位打开罚分（gapopeningpenalty），e表示空位扩展罚分（gap extension penalty），g是空位长度。d、e两个参数值设置的变化对比对结果产生的 影响如表2-4所示。